ミラノショーで2018年型YZF-R3が公開された翌日、11月8日にヤマハがYZF-R25とYZF-R3の国内仕様を発表した。2018年型で大幅に刷新したカワサキNinja250や2017年にデビューしたホンダCBR250RRらにモデルチェンジで対抗することも考えられたが、2018年モデルは排ガス規制に対応しカラーリングを刷新することが明らかになった。
R25は1万円アップ＆1psダウン
2018年モデルは青、黒、白のカラーバリエーションはそのままに、青は銀とのツートンを黒に、黒はマットブラックが通常のブラックに、白はグラフィックを変更するとともにホイールを黒→黄色に変更した。その他平成19年排ガス規制→平成28年排ガス規制対応となっており、R25の最高出力が27kW（36PS）/12000rpm→26kW（35PS）/12000rpmに1psダウン。R3は最大トルクが30Nm（3.0kg-m）／9000rpm→29Nm（3.0㎏-m）/9000rpmで1Nmダウンとなった。一方で両車とも燃費は大きく向上している（下段スペック表参照）。
